Sistemas biológicos
Esta es nuestra linea de investigación más reciente y que acaba de comenzar.
En esta línea dedicaremos gran esfuerzo en los próximos años.
Algunos objetivos que tenemos dentro de este ámbito son:
Separación de mezclas racémicas.
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Un gran número de moléculas biologicas presentan isomería óptica.
Resulta de gran interés industrial la separación de las moléculas con
forma L de las moléculas de tipo D. Una posible via para este objetivo
es la cristalización. Pretendemos, utilizando simulación por ordenador
entender cuando es posible y cuando no separar isómeros opticos mediante
cristalización.
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Agua.
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El agua está presente en todos los sistemas biologícos. Resultaría de
gran utilidad el obtener un modelo de potencial para el agua que fuera
capaz de explicar el mayor número posible de hechos experimentales para
el agua. Esto es aun más importante si se tiene en cuenta que la
existencia de un buen modelo para el agua es imprescindible para
la realización con éxito de simulaciones de moléculas biológicas.
En la foto se presenta una configuracion tipica del agua liquida,
a T y p ambiente y del hielo a T y p ambiente.
Simulación de aminoácidos.
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Pretendemos simular aminoácidos y peptidos pequenos en disolución
incorporando los últimos avances disponibles en simulación molecular
(sumas de Ewald, configurational bias)
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Modelos simples de proteinas.
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También pretendemos realizar simulaciones de proteinas utilizando
modelos sencillos. En particular pretendemos mejorar la comprensión
sobre los factores que afectan/ayudan la cristalización de una proteina
la cual resulta imprescindible para su caracterización estructural por
Rayos X.
